一楼东、西两侧分别被划定为一号候车区和二号候车区，二楼东、西两侧分别被划定为三号候车区和四号候车区，北站房二楼候车平台被划定为五号候车区。其中，三号候车区是专门为乘坐城际列车旅客设置的候车区，以此分担五号候车区日益增长的高铁客流。

南、北站房之间由联系通道连接合为一体，出站地道全面实现贯通，形成了常州站“两场一站”的乘降格局。旅客可根据需要自由选择常州站南、北站房进、出站，免去了大量旅客带着大包小包的绕行之苦，旅客出行更加便捷。