应该是毛利兰，原因如下：

1、两人是青梅竹马，新一未变小前便是毛利兰的男朋友，变小后也总是在关键时刻保护毛利兰；

2、新一为了毛利兰拒绝过一位学姐的追求，因此新一心里是喜欢毛利兰的；

3、在灰原哀遇到危险时，新一能果断冷静地思考救人方案，而当毛利兰遇到危险时，他总是猜想，犹豫，慌乱，只有在喜欢一个人时，才会在那个人遇到危险时如此慌乱害怕;

4、有男生向毛利兰表达好感时，新一会吃醋；

5、步美在《通向天国的倒计时》中说：“柯南喜欢小兰姐姐”，旁观者清，步美都看出来柯南喜欢毛利兰。