艾滋病最早在非洲出现，随着移民的迁移，渐渐从非洲传入到各个地区和国家，但真正被发现并且确定为艾滋病的患者是在美国。在艾滋病病毒的自然演化假说中，根据对HIV1型、HIV2型以及猴艾滋病病毒的全面系统分析，目前基本被接受的理论是HIV1型和HIV2型分别起源于不同的灵长类动物猴艾滋病病毒。

即HIV1型起源于非洲黑猩猩种的猴艾滋病病毒，而HIV2型则起源于非洲白眉猴中的猴艾滋病病毒，经过种种途径传入人体后，在人体内经过一系列的变异，最终适应了人体环境并长期存活下来。