一、科目分类不同

1、鲭鱼

鲭鱼，俗称炸弹鱼，属硬骨鱼纲、鲈形目、鲭科、鲣属。

2、金枪鱼

金枪鱼一般指金枪鱼族，属辐鳍鱼纲、鲭形目、鲭科、细鲣属、舵鲣属、鲔属、鲣属、金枪鱼属。

二、形态特征不同

1、鲭鱼

身体为纺锤形，蓝色，粗壮，无鳞，体表光滑，尾鳍非常发达，体侧腹部有数条纵向暗色条纹，背侧具线色斑条。尾鳍新月形，体侧具4至7条纵条纹，体背蓝褐色，腹部银白，各鳍浅灰色，头大，吻尖，尾栖细小。

2、金枪鱼

金枪鱼两端呈锥形，嘴巴适中，牙齿发育良好。鳃膜不附着于咽峡部。鳞片呈摆线状，通常很小，体色呈金属色，通常为蓝色和银色。金枪鱼有暗带和鳍。背鳍由9到27条密集排列的鳍组成，腹鳍有6条鳍。